1902年，万瀚深成立于荷兰格罗宁根省。最初，公司全称为S. van Hessen & Zoon，此后曾更名为荷兰动物副产品实业有限公司，并最后定名为万瀚深。

鉴于格罗宁根省狭小的市场空间，总经理路德维格先生决定于1914年将公司迁往鹿特丹。此后，公司业务迅速扩展到德国境内，并在汉堡开设了一家高度现代化的制造工厂，以满足公司不断增长的业务需求。然而，考虑到德国当时严峻的政治局势，公司将业务重心投向了德国以外的市场。

1931年，公司在路德维格先生的经营下已颇有声色。那时，家族的另一成员保罗.范.万瀚深（路德维格外甥的儿子）也希望积极参与公司的业务之中。1933年，保罗加入公司并很快掌握了公司的业务。最后，路德维格先生逐步将日常业务移交至保罗名下。

然而，1934年风云突变，保罗为国履行兵役义务，路德维格先生不得不重掌公司日常业务。此外，当欧洲肠衣行业竞争日益严峻之际，路德维格率先开辟中国市场，在中国寻找到了质优价廉的肠衣产品，从而取得了可观的利润。

时至1937年，公司战前营业额高达750,000荷兰盾。然而，二战的爆发深刻改变了公司及万瀚深家族的命运。1940年，一家名为荷兰动物副产品实业公司的新公司成立，为免遭纳粹侵略者掠夺，老公司的所有资产全部纳入新公司实体。万瀚深家族仍然以新公司实体进行运作，万瀚深的家族业务交由几位朋友照料。

战争期间，保罗.范.万瀚深逃亡伦敦后，成了英国皇家空军和荷兰皇家海军航空大队的空军军官，曾25次奉命出击敌方的领土。
至1945年二战结束，保罗的父母和路德维格.范.万瀚深先生在纳粹集中营中不幸逝世。路德维格先生的女儿们得以幸免，战后与保罗和许多忠诚员工重操旧业。公司自此获得重生并建立了众多关联企业协助其业务增长。万瀚深业务范围已遍及南美、美国、中东、澳大利亚和新西兰等地。二十世纪五十年代，与中国的贸易迅速增长，截至1955年，公司步入全速增长轨道。

1964年，万瀚深将办公地点迁往了鹿特丹。1979年，随着公司业务的不断扩大，万瀚深首次在中国尝试新西兰和澳大利亚羊肠衣业务便大获成功。 1989年，万瀚深与上海星星肠衣有限公司进行合资。1994年，万瀚深位于Nieuwerkerk a/d IJssel的崭新办公大楼正式落成。新办公大楼足以容纳遍布全球的天然肠衣分销网络以及供往比利时、荷兰、卢森堡三国的人造肠衣分销网络。
2002年，万瀚深在上海成立了全新的子公司，负责管理整个集团中国境内的业务。新公司的成立标志着万瀚深在中国40多年来的奋斗成果，也象征着公司不断前进的战略旗帜。